Une partie du corps qui a des concentrations élevées de cet acide aminé particulier est le liquide prostatique. L'alanine peut aider à protéger la prostate contre l'élargissement et à réduire la douleur associée aux problèmes de prostate tels que la douleur pendant la miction, la douleur due à l'enflure et les symptômes causés par le cancer de la prostate. Certaines études ont également montré que les effets de l'alanine sur le corps offrent une protection contre l'apoptose induite par les cytokines pro-inflammatoires et améliorent la production d'antioxydants dans les cellules.
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